Toimintansa 1.1.2010 aloittanut Etelä-Savon elinkeino-, liikenne- ja ympäristökeskus ehkäisee ja vähentää ihmisen toiminnasta aiheutuvia ympäristöhaittoja ja edistää luonnonvarojen kestävää käyttöä Etelä-Savon alueella. Etelä-Savon ELY-keskus valvoo ympäristökuormitusta aiheuttavia toimintoja sekä ottaa kantaa ja antaa lausuntoja niistä. ELY-keskus osallistuu ympäristövahinkojen torjuntaan ja vahinkojen selvitystöihin antamalla asiantuntija-apua ja tarvittaessa viranomaismääräyksiä.
Etelä-Savon ELY-keskus valvoo Itä-Suomen aluehallintoviraston (AVI) antamia ympäristö- ja vesilupapäätöksiä toimialueellaan sekä myös yleistä etua ympäristö- ja vesiasioissa. Lisäksi se toimii yhteysviranomaisena ympäristövaikutusten arviointilain (YVA) mukaisissa arviointimenettelyissä sekä lausunnon antajana suunnitelmien ja ohjelmien ympäristöarvioinnissa (SOVA).
ELY-keskus edistää ympäristönsuojelua koulutustilaisuuksin ja seminaarein sekä asiantuntijoiden päivittäin tarjoaman neuvonnan avulla.