Varsinais-Suomen ELY-keskuksen toiminta-alue on
Varsinais-Suomen maakunta, Liikenne ja infrastruktuuri - sekä Ympäristö ja luonnonvarat -vastuualueiden osalta myös Satakunta. Lisäksi Satakunnan kalatalouspalvelut hoidetaan Varsinais-Suomen ELY-keskuksessa.
Varsinais-Suomi
Turunmaa: Kemiönsaari, Parainen
Salon seutu: Salo, Somero
Loimaan seutu: Aura, Koski TL, Loimaa, Marttila, Oripää, Pöytyä, Tarvasjoki
Turun seutu: Kaarina, Lieto, Masku, Mynämäki, Naantali, Nousiainen, Paimio, Raisio, Rusko, Sauvo, Turku
Vakka-Suomi: Laitila, Kustavi, Pyhäranta, Taivassalo, Uusikaupunki, Vehmaa
Satakunta
Rauman seutu: Eura, Eurajoki, Köyliö, Rauma, Säkylä
Porin seutu: Harjavalta, Huittinen, Kokemäki, Luvia, Nakkila, Pomarkku, Pori, Ulvila
Pohjois-Satakunta: Honkajoki, Jämijärvi, Kankaanpää, Kiikoinen, Karvia, Lavia, Merikarvia, Siikainen